Blog do TJPP

Bem vindo … Welcome

Aqui você encontra posts sobre Física, Complexidade, Linux, Debian, etc., enfim tudo que poderia interessar a um físico computacional.

english.jpgHere you will find news and comments about Physics, Computers, Debian, GNU/Linux, and anything else that could be of interest to a computational physicist. If you think that something here could be of interest for you but you are not a Portuguese native reader, please comment in English and I will be happy in providing you a summary of what is written in english. If you prefer, e-mail me.


Análise e modelagem estocástica do barorreflexo

20040514113350.jpg Hoje deveremos ter mais um doutor “fresco” no grupo de Sistemas Complexos. O doutorando é Carlos Eduardo Cardoso Galhardo, e o título da tese é “Análise e modelagem estocástica do barorreflexo através de séries temporais de pressão arterial sistólica” (sim, títulos de tese se parecem com títulos de sambas de enredo). A defesa é hoje às 14h no IF-UFF. Neste trabalho fizemos análise dos dados de pressão arterial de ratos em que um dos mecanismos de controle de pressão arterial, o barorreflexo, é desativado por denervação. Mostramos que um novo mecanismo de controle passa a agir dias depois, por adaptação do organismo, mas que este novo mecanismo – que não sabemos ao certo qual é – é mais lento que o barorreflexo. Propusemos um modelo simples (simples, para físicos) baseado no movimento browniano, já discutido aqui em O azeite bêbado e em Simulações com Processing.js.

Este trabalho me deixou particularmente gratificado porque antes de escolher prestar vestibular para Física, fiz um teste vocacional e deu Medicina como primeira opção. Acho que escolhi certo. Este trabalho é fruto da colaboração do nosso grupo com o Laboratório de Fisiologia do Exercício, do prof. Pedro Paulo Soares, do Instituto Biomédico da UFF. É mais um motivo para confundirem Física com Educação Física.

Sobre o estudante, o Gralha, posso dizer que o nosso grupo não será o mesmo depois dele. Foi um dos principais responsáveis por introdução do Python e técnicas como Scrum e peer-programming e um dos mais motivados estudantes que tive. Além de excelente pesquisador é um grande amigo.

O arquivo pdf da tese tem 2.7Mb e pode ser baixado aqui mesmo.

09/Jun/2010 12:41 · tjpp · 132 Comentários · 0 Linkbacks

Modelo Open-source para remédios

Muitos de vocês devem saber sobre a opção da Glaxo sobre o uso do modelo open-source para desenvolvimento de remédios (veja o link para o artigo no Wall Street Journal. Já começou bem, abrindo os modelos de 13.500 componentes químicos que podem ajudar no combate à malária. Tal notícia apareceu na lista do Grupo de Software Livre do Sul Fluminense e logo segui-se a discussão sobre que modelo adotar. Após a sugestão do luhlig (que não tem tweeter nem blog) de usar o modelo Debian para a versão estável, eu imaginei que a aplicação do modelo Debian no desenvolvimento de remédios deve ser algo como :

  1. é produzida a versão alpha da vacina que será lançada na versão instável, somente para doentes avançados e desenvolvedores da doença (também conhecidos como DDs ou disease developers). Alguns usuários podem testar, mas se morrerem, o problema é deles, deveriam ter esperado chegar na estável.
  2. após 15 dias sem relato de mortes, a vacina entra na fase testing. Quando o número de bugs da vacina cai, ela entra na fase freezing, onde nenhum novo ingrediente pode ser adicionado e a vacina é colocada no refrigerador. Existe um atraso no lançamento da vacina pois o logotipo da seringa não é livre. É criada então a Ice-ringa.
  3. Quando a vacina e todos os medicamentos relacionados à ela são suficientemente testados e o número de mortos é razoavelmente baixo, é lançada a versão estável da vacina e dos medicamentos. Em geral, neste estágio, o vírus já sofreu milhares de mutações e pertence a uma linhagem diferente e ninguém mais tem aquela doença.
  4. Se der sorte e o vírus não for muito diferente, talvez você consiga uma atualização de segurança (caso os DDs não morram enquanto estiverem testando a vacina).
  5. Alguns DD debandarão para outra firma e tentarão copiar tudo que a concorrente (P)fizer pois os comprimidos azuis com a logomarca monocromática são uma obra prima do design - apesar de só poderem ser tomados com a água especial (iH20), mas isto não é bug, é compatibilidade. A concorrente se destaca pois os pacientes não querem saber do que estão tomando, querem apenas que a vacina seja fácil de aplicar e que a mesma pisque se colocar o dedo em cima.

Particularmente acho que o modelo Arch Linux deveria ser adotado. Se alguém entende de pílulas é o pacman.

05/Jun/2010 12:03 · tjpp · 0 Linkbacks

A mancha de óleo na sua casa

A teia também não tem sido atualizada tão frequentemente, já que o aracnus também debandou para o microblogging. Assim, eu vou RT o post. A melhor ferramenta para se entender qual o tamanho da mancha de óleo que vazou da explosão da plataforma da BP no Golfo do México é o site http://www.ifitwasmyhome.com/. Com ele você consegue ver qual a dimensão da mancha, se a mesma fosse no local onde você mora. Veja como seria em Niterói (clique para uma versão maior):

manchadeoleo.jpg

Assustador… ou na gíria da internet: tenso.

03/Jun/2010 11:15 · tjpp · 1 Linkback

Isto é que é memória

Visitei a página do Linux Logo. o LinuxLogo faz aparecer umas figuras em ASCII, como estas, no seu console

É legal ver o Changelog:

  • I released version 5.09 on 16 February 2010. It fixes a display bug on machines with more than 100GB of memory.

Imaginem: 100GB e nem é para rodar o Firefox e o OpenOffice, é só no console. Chegar na loja e pedir 4 pentes de 32Gb.

21/May/2010 14:51 · tjpp · 0 Linkbacks

Como um projeto de software cresce

Há um ano postei aqui apresentando a dissertação sobre a rede de dependências de pacotes do Debian. Hoje conheci uma interessante ferramenta de visualização de controle de versão: o Gource. Ele monta a evolução do projeto com diretórios sendo os ramos das árvores. Dá para ver a estrutura hieráquica e mesmo em alguns casos, nota-se bem que o software não cresce uniformemente, mas tem momentos de bursts, onde o crescimento de galhos é mais rápido. No vídeo abaixo, é mostrada a evolução de vários softwares opensource famosos. É interessante ver como alguns desenvolvedores tem uma visão global do projeto e outros se dedicam a ramos específicos. Divirtam-se!

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20/May/2010 08:40 · tjpp · 0 Linkbacks

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blog.txt · Última modificação: 16/Apr/2010 09:40 por tjpp
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